Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam50aQ9WV03 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50aQ9WV03 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms