Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms