Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrkQ9R0G8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms