Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vav3Q9R0C8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms