Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf4Q9QZS2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms