Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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