Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms