Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms