Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmlQ9QZD5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ChmlQ9QZD5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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