Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms