Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms