Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Tomm40Q9QYA2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tomm40Q9QYA2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tomm40Q9QYA2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tomm40Q9QYA2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tomm40Q9QYA2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tomm40Q9QYA2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tomm40Q9QYA2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms