Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms