Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pkp3Q9QY23 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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