Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms