Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms