Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms