Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms