Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Prg4Q9JM99 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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