Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp1Q9JLK7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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