Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col5a3Q9JLI2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col5a3Q9JLI2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col5a3Q9JLI2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Col5a3Q9JLI2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col5a3Q9JLI2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Col5a3Q9JLI2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col5a3Q9JLI2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms