Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms