Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cnot9Q9JKY0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cnot9Q9JKY0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cnot9Q9JKY0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cnot9Q9JKY0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms