Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AatfQ9JKX4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AatfQ9JKX4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms