Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp5Q9JKD3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms