Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riox1Q9JJF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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