Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms