Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rpf2Q9JJ80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpf2Q9JJ80 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpf2Q9JJ80 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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