Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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