Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1aQ9JIC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms