Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EefsecQ9JHW4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms