Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcirg1Q9JHF5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms