Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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