Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trim39Q9ESN2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trim39Q9ESN2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim39Q9ESN2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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