Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms