Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SyncQ9EPM5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms