Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a1Q9EPE9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a1Q9EPE9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms