Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp7Q9EPC5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp7Q9EPC5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms