Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp3Q9EP97 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms