Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufa8Q9DCJ5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms