Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms