Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms