Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmg20aQ9DC33 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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