Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnk1dQ9DC28 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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