Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms