Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrn2Q9DBR1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrn2Q9DBR1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms