Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms