Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms