Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms