Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms